Ny mpikaroka dia nampiasa ny pipeline sy metagenomics stable isotope probing (HT-SIP) vaovao avo lenta mba hijerena voalohany ny microbiome mavitrika manodidina ny symbiont zavamaniry mahasoa, arbuscular mycorrhizal fungi (AMF). Credit: Lawrence Livermore National Laboratory
Ny fampifandraisana ny mombamomba ny mikraoba dia miaraka amin'ny toetrany ara-batana sy ny asany ara-tontolo iainana no tanjona fototra ho an'ny mikrôbiôlôjia momba ny tontolo iainana. Amin'ireo teknika mikatsaka izany tanjona izany, ny Stable Isotope Probing—SIP—dia heverina ho mahomby indrindra amin'ny fandalinana ireo zavamiaina bitika ao amin'ny tontolo voajanahary.
Ny mpahay siansa Lawrence Livermore National Laboratory (LLNL) dia namolavola teknika vaovao - SIP avo lenta - izay manara-maso ny dingana maromaro amin'ny dingan'ny fizahana isotope miorina, mamela ny fanadihadiana momba ny asan'ny mikraoba amin'ny zavamiaina bitika ao anatin'ny toe-javatra tena misy, tsy mila fikarakarana laboratoara.
Ao amin'ny SIP, ny mikraoba mavitrika dia fantatra amin'ny alàlan'ny fampidirana isotopes stable amin'ny biomass. Anisan'ny fomba mahery vaika indrindra amin'ny ekolojia mikraoba izy io satria afaka mamantatra ny mikraoba mavitrika sy ny toetrany ara-batana (fampiasana substrate, biochemistry cellule, metabolism, fitomboana, fahafatesana) any amin'ny vondrom-piarahamonina sarotra ao anatin'ny toe-piainana teratany.
Amin'ny ankapobeny, ny fomba SIP dia mitaky asa tanana be dia be ary manome santionany vitsivitsy ihany. Saingy ny teknika LLNL vaovao dia mitaky ampahaenina ny habetsaky ny asa tanana raha oharina amin'ny SIP manual ary mamela santionany 16 hokarakaraina miaraka.
"Ny fomba fiasa semi-automatique dia mampihena ny fotoanan'ny mpandraharaha ary manatsara ny famerenana indray amin'ny alàlan'ny fikatsahana ny dingana manasa-tena indrindra amin'ny SIP," hoy i Erin Nuccio, mpahay siansa LLNL, ary mpanoratra mpanoratra iray hita ao amin'ny diary Microbiome. "Nampiasa an'io fomba io izahay izao mba hikarakarana santionany an'arivony, anisan'izany ny sasany avy amin'ny microhabitats tany tsy dia nianatra loatra."
Iray amin'ireny microhabitat ireny ny tany manodidina avy hatrany ny tadin'ny mycorrhizae—karazana holatra izay mamorona fifandraisana simbiotika amin'ny 72% amin'ny zavamaniry rehetra an-tanety. Ho takalon'ny karbaona zavamaniry, ny holatra (arbuscular mycorrhizal fungi) dia manome ny mpampiantrano azy ireo loharano ilaina toy ny azota, phosphor ary rano.
Ao anatin'ity fanadihadiana momba ny foto-kevitra ity dia nasehon'ny mpanoratra ny "tranonkala sakafo" amin'ny fifandraisana atosiky ny holatra mycorrhizal amin'ny tany.
“Mihevitra izahay fa lalana iray lehibe amin'ny fiparitahan'ny karbaona amin'ny tany malalaka io. Ny tany dia mitazona ny dobo lehibe indrindra amin'ny karbaona organika mavitrika mivezivezy eto an-tany, "hoy ny mpanoratra mpiara-miasa Jennifer Pett-Ridge, izay mpitarika ny tetikasa LLNL ary lehiben'ny Biraon'ny Siansa momba ny angovo "Microbes Persist" Soil Microbiome Scientific Focus Area. . "Nanangona ADN kely izahay, namaritra ny zavamananaina mavitrika ary avy eo nanamboatra ny fototarazony sy ny fifandraisana mety hitranga."
Ny mpanoratra LLNL hafa dia ahitana an'i Steven Blazewicz, Marissa Lafler, Ashley Campbell, Jeffrey Kimbrel, Jessica Wollard, Rachel Hestrin ary koa ireo mpikaroka avy amin'ny Lawrence Berkeley National Laboratory, ny DOE Joint Genome Institute ary ny University of California, Berkeley.